中文Нов вариант на коронавирус щам 501Y-V2 от Южна Африка
На 18 декември 2020 г. Южна Африка откри 501Y-V2 мутант на новия коронавирус.Сега южноафриканският мутант се е разпространил в повече от 20 страни.Експериментите показват, че по-горе новите мутанти на коронавирус може да носят други нови варианти на коронавирус на K417N/T, E484K и N501Y мутации, които могат да намалят неутрализиращата способност на индуцираните от ваксината плазмени неутрализиращи антитела.Въпреки това, в сравнение с референтния геном Wuh01 (пореден номер MN908947), 501Y.V2 на последователността на мутантен геном на Южна Африка има 23 нуклеотидни варианта.Той има същата N501Y мутация като британския мутант B.1.1.7 подтип, но все още съдържа мутации в две ключови места E484K и K417N на S протеин, които имат потенциално важни ефекти върху способността на вируса да заразява.
Новият коронавирус е едноверижен РНК вирус, чийто геномни мутации са по-чести.Откриването на една цел може лесно да доведе до пропуснато откриване на проби с нисък вирусен товар и мутирали вирусни щамове.Степента на повторно изследване при единично положително откриване на целта може да достигне повече от 10%, което може да увеличи натоварването и да удължи времето за диагностика.Откриването на множество цели и взаимната проверка на резултатите от всяка цел може да увеличи степента на откриване и да улесни ранната диагностика.
Фигура 1. Схематична диаграма на механизма на заразяване с новия коронавирус
Нов коронавирус мутант B.1.1.7 от Великобритания
На 26 декември 2020 г. първата научна статия за щама B.1.1.7 беше публикувана онлайн.Институтът по хигиена на Лондонския университет в Обединеното кралство и тропическите болести потвърди, че щамът B.1.1.7 е по-способен да се разпространява от други щамове, което е повече от 56% (95% CI 50-74%).Тъй като този нов мутантен щам има по-очевидна мощност на предаване, стана по-трудно да се контролира COVID-19.На следващия ден Университетът на Бирмингам в Обединеното кралство качи статия в MedRxiv.Проучването установи, че броят на генните копия на ORF1ab и N вируса при пациенти, заразени с мутантен щам B.1.1.7 (отпадане на S-ген), е значително увеличен;това явление беше наблюдавано сред населението.Тази статия посочва, че пациентите, заразени с мутанта B.1.1.7 от Великобритания, имат значително по-висок вирусен товар, така че този мутант може да бъде и по-патогенен.
Фигура 2. Последователността на геномна мутация, съдържаща се в коронавирусния мутантен щам B.1.1.7 от Великобритания
Фигура 3. Мутация N501Y, възникнала както във Великобритания, така и в Южна АфрикаВарианти
Комплект за откриване на нови варианти на коронавирус
Chuangkun Biotech Inc. успешно разработи комплект за откриване на B.1.1.7 и 501Y-V2 нови варианти на коронавирус.
Предимства на този продукт: висока чувствителност, едновременно откриване на 4 цели, покриващи основните места на мутация на B.1.1.7 мутантен щам и 501Y.V2 Южноафрикански мутантен щам.Този комплект може едновременно да открие местата на мутация N501Y, HV69-70del, E484K и новия S ген на коронавируса;Бърз тест: отнема само 1 час и 30 минути от вземането на пробата до резултата.
Фигура 4. Крива на усилване на варианта на COVID-19 във Великобритания
Фигура 5. Крива на усилване на южноафриканския вариант на COVID-19
Фигура 6. Див тип крива на усилване на нов коронавирус
Не е ясно как тези мутации натрупват ново дългосрочно въздействие на пандемията COVID-19 вдясно.Но това ни напомня, че тези мутации могат да повлияят на ефективността на естествения имунитет и имунитета, предизвикан от ваксинацията.Освен това ни напомня, че трябва непрекъснато да наблюдаваме новия коронавирус за дълго време и да актуализираме ваксината срещу COVID-19, за да се справим с еволюцията на новия коронавирус.
Време на публикуване: 12 март 2021 г