CHKBiotech успешно разработи комплект за откриване на нови варианти на коронавирус

Нов вариант на коронавирусен щам 501Y-V2 от Южна Африка
На 18 декември 2020 г. Южна Африка откри 501Y-V2 мутант на новия коронавирус. Сега южноафриканският мутант се е разпространил в повече от 20 страни. Експериментите показват, че по-горе Новите коронавирусни мутанти могат да носят други варианти на нови коронавируси на мутации K417N / T, E484K и N501Y, които могат да намалят неутрализиращата способност на индуцираните от ваксината плазмени неутрализиращи антитела. Въпреки това, в сравнение с референтния геном Wuh01 (пореден номер MN908947), 501Y.V2 на южноафриканската мутантна геномна последователност има 23 нуклеотидни варианта. Той има същата мутация N501Y като британския мутант B.1.1.7 подтип, но все още съдържа мутации на две ключови места E484K и K417N на S протеин, които имат потенциално важни ефекти върху способността на вируса да зарази.

Новият коронавирус е едноверижен РНК вирус, при който геномните мутации са по-чести. Откриването с една цел може лесно да доведе до пропуснато откриване на проби с ниско вирусно натоварване и мутирали вирусни щамове. Скоростта на повторно изследване при единично положително в откриването на целта може да достигне повече от 10%, което може да увеличи натоварването и да удължи времето за диагностика. Многоцелевото откриване и взаимната проверка на резултатите от всяка цел могат да увеличат степента на откриване и да улеснят ранната диагностика.

news1

Фигура 1. Схематична диаграма на новия коронавирусен инфекциозен механизъм

Нов коронавирусен мутант B.1.1.7 на Великобритания
На 26 декември 2020 г. първата научна статия на щама B.1.1.7 е публикувана онлайн. Институтът по хигиена в Лондон, Великобритания и тропическите болести, потвърди, че щамът B.1.1.7 е по-способен да се разпространява от другите щамове, което е повече от 56% (95% CI 50-74%). Тъй като този нов мутант щам има по-очевидна мощност на предаване, стана по-трудно да се контролира COVID-19. На следващия ден Университетът в Бирмингам в Обединеното кралство качи статия за MedRxiv. Проучването установи, че броят на копията на гена на вируса ORF1ab и N при пациенти, заразени с мутантния щам B.1.1.7 (отпадане на S-ген), е значително увеличен; това явление се наблюдава в популацията. Тази статия посочва, че пациентите, заразени с мутант В.1.1.7 от Великобритания, имат значително по-висок вирусен товар, така че този мутант може да бъде и по-патогенен.

1

Фигура 2. Геномна мутационна последователност, съдържаща се в коронавирусния мутант щам B.1.1.7 на Великобритания

2

Фигура 3. Мутация N501Y се наблюдава както във Великобритания, така и в Южна Африка Варианти

Комплект за откриване на нови варианти на коронавирус
Chuangkun Biotech Inc. успешно разработи комплект за откриване на нови варианти на коронавирус B.1.1.7 и 501Y-V2.

Предимства на този продукт: висока чувствителност , едновременно откриване на 4 цели, покриващи основните места за мутация на мутантния щам B.1.1.7 и 501Y.V2 южноафрикански мутантен щам. Този комплект може едновременно да открива местата за мутация N501Y, HV69-70del, E484K и новия ген на коронавирус S; Бърз тест: от вземането на пробата до резултата отнема само 1 час и 30 минути.

3

Фигура 4. Откриване на кривата на усилване на варианта на Великобритания COVID-19

4

Фигура 5. Откриване на кривата на усилване на южноафриканския вариант на COVID-19

5

Фигура 6. Дива крива на усилване на нов коронавирус

Не е ясно как тези мутации натрупват ново дългосрочно въздействие на пандемията COVID-19 вдясно. Но това ни напомня, че тези мутации могат да повлияят на ефективността на естествения имунитет и имунитета, предизвикан от ваксинацията. Също така ни напомня, че трябва непрекъснато да наблюдаваме новия коронавирус дълго време и да актуализираме ваксината COVID-19, за да се справим с еволюцията на новия коронавирус.


Време за публикуване: март-12-2021